Program Studi (Prodi) Pendidikan Agama Islam (PAI) Fakultas Tarbiyah dan Keguruan (FTK) Universitas Islam Negeri (UIN) Ar-Raniry Banda Aceh untuk selanjutnya disebut Prodi PAI FTK UIN Ar-Raniry Banda Aceh merupakan prodi tertua yang lahir bersamaan dengan lahirnya Fakultas Tarbiyah pada tanggal 15 Desember 1963, dan diresmikan oleh Menteri Agama RI K.H. Saifuddin Zuhri.

Dalam kurun waktu 60 tahun, prodi PAI telah menghasilkan puluhan ribu lulusan sarjana S-1 PAI. Sebagian besar lulusan tersebut telah tersebar sebagai Guru di sekolah/madrasah dan Dosen di beberapa kampus baik di dalam maupun di luar Provinsi Aceh.

Sepanjang sejarahnya, tokoh-tokoh yang pernah memimpin Prodi PAI FTK UIN Ar-Raniry Banda Aceh adalah:

1. Drs. Ibrahim Husen, MA. (1962 s.d 1965)
2. Drs. Abdullah Sarong. (1966 s.d 1970)
3. Drs. Helmi Basyah. (1971 s.d 1975)
4. Drs. Abdurrahman Ali. (1976 s.d 1980)
5. Drs. M. Nur Ismail, LML. (1981 s.d 1986)
6. Dra. Hafsah Abdul Wahab. (1987 s.d 1991)
7. Dra. Raihan Putry, M. Pd. (1992 s.d 1996)
8. Drs. Muslim RCL, SH., M.Ag. (1997 s.d 2001)
9. Drs. M. Razali Amin. (2002 s.d 2006)
10. Drs. Umar Ali Aziz, MA. (2007 s.d 2011)
11. Drs. Bachtiar Ismail, MA. (2012 s.d 2016)
12. Dr. Jailani, S.Ag., M.Ag. (2017 s.d 2018)
13. Dr. Husnizar, S.Ag., M.Ag. (2018 s.d 2021)
14. Dr. Marzuki, S.Pd.I., M.S.I. (2021 s.d sekarang)