Program Studi Manajemen Pendidikan Islam (MPI) Fakultas Tarbiyah dan Keguruan UIN Ar-Raniry Banda Aceh merupakan salah satu Program Studi Strata satu (S1) yang berada di bawah naungan Fakultas Tarbiyah dan Keguruan UIN Ar-Raniry. Sebelumnya Prodi ini bernama Program Studi Kependidikan Islam Bimbingan Konseling (KI-BK). Pada masa awal pendiriannya, tepatnya di bulan September 1995, Program Studi Manajemen Pendidikan Islam bernama Program Studi Kependidikan Islam Fakultas Tarbiyah IAIN Ar-Raniry Banda Aceh dengan ketua Prodi pertama bapak Drs. Rusdin Pohan, dengan jumlah mahasiswa perdana sejumlah 47 orang.

Prodi ini telah dipimpin oleh beberapa Ketua Prodi yaitu, Drs. Adriman Kimat., Prof. Dr. H. M. Nasir Budiman, MA., Prof. Dr. Muhibbuthabry, M.Ag., Prof. Dr. H. Warul Walidin, MA., Prof. Drs. Amirul Hadi, MA, Ph.D., Dr. Ismail Ansari, MA., Drs. Razali M. Thaib, M.Pd., Drs. Siti Rosmawar, M.Pd., Fatimah Ibda, M.Si., Dr. Basidin Mizal, M.Pd., Dr. Mumtazul Fikri, MA., dan Dr. Safriadi, M.Pd., Seiring dengan perkembangan keilmuan serta hasil kesepakatan bersama asosiasi perkumpulan ketua Prodi KI se-Indonesia dan berdasarkan Keputusan Direktur Jenderal Pendidikan Islam No. 2754 Tahun 2012 tentang penyesuaian nomenklatur Prodi pada IAIN Ar-Raniry Banda Aceh Jurusan Kependidikan Islam Fakultas Tarbiyah dan Keguruan berganti nama menjadi Program Studi Manajemen Pendidikan Islam Fakultas Tarbiyah dan Keguruan UIN Ar-Raniry Banda Aceh.